Если вы выберете слева (Document A) версию V1, а справа (Document B) - версию V9, тогда:
_
Версия V1 (начальная) будет условно приниматься за "финальную", так как она проставлена в левом блоке как "Document A".
Соответственно все изменения будут наоборот. То есть если в новой версии V9 были созданы дополнительные элементы, то в данном сравнении они будут значиться как "удалённые". Все дельты изменений тоже будут с другим знаком, но численно такими же.
Для того чтобы сравнить наиболее свежую версию со старой, просто укажите актуальную первой.